该建筑尺寸为23x17m，高17m。在它的东南角，有一个带有鹰图案的砖装饰。除西侧正门外，北墙中间有一侧门。
约翰接管父亲的遗产後，还对该建筑的中央、後殿进行广泛修复，以及增加了四个外部扶壁，同时屋顶覆盖着铅板。
内部空间以十二边形底座上的大圆顶为主。通过巧妙的建筑布置，将穹顶支撑隐藏在会幕的主墙和两对柱子上，内部宽敞而宽敞，许多窗户穿过穹顶增强了这种效果。
主圆顶被建筑物角落的四个较小的圆顶包围。
修道院内的壁画是当时的君士坦丁堡学派的典范。北墙和南墙是圣徒的大型雕像，北侧左边是伊萨克的父亲阿莱克修斯一世，右边是他的哥哥安德罗尼科斯;以及他的大哥约翰二世·科穆宁。
壁画的内容包括圣徒、主教和五旬节等等，以及以撒的盖子。
1183年冬天，安德罗尼卡一世·科穆宁在这里访问了他父亲的墓地。1195年4月，被阿历克塞三世废黜的安格洛斯皇帝伊萨克二世就是在此地失明。在第四次十字军东征後，它被拉丁人占据。
随之时间的推移，贝拉修道院在十四世纪时已经成为了当地逃难农民的避难所；直到1370年左右被奥斯曼人攻占，不久被改造为清真寺。
1920年它再次成为希腊的一部分，1940年修复并重新改造为教堂。
自伊萨克·科穆宁修建完贝拉修道院开始，他和他的儿子约翰便常年定居在此。後者在空余时间里，经常与一群文人墨客悠闲地讨论诗歌、小说，以及神学问题。
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